ژنومیک تطبیقی یک رشته تحقیقات بیولوژیکی است که در آن ویژگی های ژنومیک موجودات زنده مختلف مقایسه می شوند. این ویژگی ها شامل دنباله DNA، ژن ها، ترتیب ژن ها، دنباله های کنترلی، و سایر ویژگی های ساختارهای ژنومیک می باشند. در این شاخه از ژنومیک، قطعات بزرگ یا تمام ژنوم های حاصل از پروژه ژنوم مقایسه می شوند تا بتوان شباهت ها و تفاوت های پایه ای بیولوژیکی و روابط تکاملی بین موجودات مختلف را مطالعه کرد. ق...