دانشگاه اسلامی تاجیکستان به نام امام اعظم ابوحنیفه در سال ۱۹۹۷ میلادی، پس از برچیدن ادارهٔ مُفتیات با تصویب انجمن مسلمانان جمهوری تاجیکستان در موافقت با کمیتهٔ عاید به کارهای دینی نزد جمهوری تاجیکستان تشکیل گردید.دانشگاه با یاری متخصصانی از دانشگاه ملی تاجیکستان، آکادمی (فرهنگستان) علوم، دانشگاه آموزگاری، دانشگاه بین المللی الازهر مصر، وزارت معارف (آموزش و پرورش) جمهوری و کمیتهٔ عاید به کارهای دین...